2003年教育部正式启动研究生教育创新计划，并列为《2003-2007 年教育振兴行动计划》的重要内容。2005年1月，教育部印发了《关于实施研究生教育创新计划，加强研究生创新能力培养，进一步提高培养质量的若干意见》（教研[2005]1号），进一步明确了实施研究生教育创新计划的指导思想、主要任务和实施办法。研究生教育创新计划项目包括全国博士生学术论坛、全国研究生暑期学校、全国博士生学术会议、研究生国内访学、研究生创新中心、研究生培养机制改革等。